DYCP-31DN sistem je horizontalni sistem za elektroforezu. U horizontalnoj gel elektroforezi, gel se baca u horizontalnoj orijentaciji i potapa u tekući pufer unutar kutije za gel. Kutija sa gelom je podijeljena u dva odjeljka, a gel agaroze ih razdvaja. Kao što je ranije rečeno, anoda se nalazi na jednom kraju, dok se katoda nalazi na drugom. Jonski tekući pufer omogućava stvaranje gradijenta naboja kada se primjenjuje struja. Osim toga, pufer služi za hlađenje gela, koji se zagrijava pri nanošenju punjenja. Pufer koji radi se često recirkulaciju kako bi se spriječilo stvaranje pH gradijenta. Imamo različite veličine češljeva za upotrebu. Različiti češljevi čine ovaj sistem horizontalne elektroforeze idealnim za bilo koju primenu agaroznog gela, uključujući podmonsku elektroforezu, za brzu elektroforezu sa malim količinama uzoraka, DNK, podmorsku elektroforezu, za identifikaciju, odvajanje i pripremu DNK, i za mjerenje molekulske težine.
Tokom elektroforeze, gel se formira u posudi za livenje. Posuda sadrži male "bunariće" koje drže čestice koje želite da testirate. Nekoliko mikrolitara (µL) otopine koja sadrži čestice koje želite testirati pažljivo se ubacuje u jažice. Zatim se pufer, koji provodi električnu struju, sipa u komoru za elektroforezu. Zatim se posuda za livenje, koja sadrži čestice, pažljivo stavlja u komoru i uranja u pufer. Konačno, komora se zatvara i uključuje se izvor napajanja. Anoda i katoda, stvorene električnom strujom, privlače suprotno nabijene čestice. Čestice se polako kreću u gelu prema suprotnom naboju. Napajanje je isključeno, a gel se izvadi i pregleda.